A croire qu'on fait exprès de commencer par le plus difficile ! On n'a eu la réponse à cette réponse que tardivement et de nombreuses hypothèses ont courues :

- XANA fut, pour certains fans, un virus informatique qui aurait infesté le Superordinateur, le rendant fou ! La menace serait donc venue de l'extérieur ! Cette solution ne pourrait pas viable, car il aurait fallu un virus d'une puissance insoupçonnée pour pouvoir investir une machine aussi complexe que le Supercalculateur et s'en servir d'une telle manière ! Même en supposant que cela soit possible, rien n'aurait pu expliquer que le virus décide de se servir de la machine pour détruire le monde, ni qu'il comprenne toutes les fonctionnalités du Superordinateur !

- Une autre hypothèse, et il s'agit de cette version que l'on trouve parfois dans les livres de Code Lyokô, serait que XANA serait le Superordinateur lui-même ! Cette théorie se confirme par certaines citations de nos héros comme celle de Jérémie dans l'épisode 26 « Faux départ » : « On va désactiver XANA, ça vous tente ? » ou celle d'Odd dans l'épisode 22 « Routine » : « Mais pourquoi XANA s'infecterait lui-même ».
On ne saurait pourtant pas les raisons pour lesquelles cette machine infernale se bornerait à vouloir détruire la Terre et avant tout, comment elle aurait accédé à la conscience !

- Certaines hypothèses peuvent être plus loufoques et improbables, mais on a aussi pu imaginer que XANA était en fait un autre opérateur, comme Jérémie qui oeuvrait sur un terminal différent (comme dans une deuxième usine)...

Aujourd'hui ces divers fantasmes ont été abattus par la version officielle :

La réponse à la question est cependant donnée durant l'épisode 57 « Aelita » ! Je cite donc Franz Hopper qui explique à sa fille qui est XANA :

« - Un programme multi-agents que j'ai créé... Il a accédé à la conscience et cherche maintenant à nous éliminer ! »

Cette citation balaie au passage la dernière théorie comme quoi XANA est un programme, mais infesté par un virus ! XANA s'est émancipé lui-même, sans intervention extérieure !

Il est donc un programme multi-agents ! Il a la compétence de pouvoir gagner en puissance par lui-même et ladite prise de conscience a fait de lui un programme dangereux.